Un sombrío autoproclamado ermitaño llamado Momoyuki Mogura, alias Mogura, es expulsado de la vida después de la muerte debido a un incidente. Ahora colecciona fuegos fatuos poseídos por espíritus en su linterna, con la esperanza de regresar. Parece que quienes lo conocen comienzan a ver cosas extrañas.

Kusakabe Renji, un joven que trabaja en un salón arcade, ve a una chica inglesa llamada Lily Baker jugando a la grúa el día de San Valentín. Viendo cómo la chica no consigue hacerse con un premio pese a sus múltiples intentos, Renji no puede evitar tomar cartas en el asunto. El día después de que Lily consiga por fin su peluche, Renji recibe un mensaje inesperado de la chica que pone: "¡Sé mi Valentín!". Lo que empieza siendo un malentendido acaba convirtiéndose en un intercambio cultural.

El joven Tatsumi viaja a la capital del Imperio con el propósito de ganar dinero para su pueblo hambriento y se encuentra con un mundo de depravación inimaginable, dominado por el despiadado Primer Ministro que controla al niño Emperador. Tatsumi es reclutado por Night Raid, un grupo de asesinos dedicado a eliminar la corrupción matando sin piedad a funcionarios y nobles privilegiados.

La acción empieza tras los dos años y medio que el protagonista, Naruto Uzumaki, ha pasado entrenando con su maestro Jiraiya. En ella reaparecen todos los personajes de la anterior serie pero con más experiencia y fuerza. Además, la Organización Akatsuki entra definitivamente en acción, tras su breve aparición en la parte anterior, y se revelan sus objetivos. El enemigo principal de la parte anterior de Naruto, Orochimaru, ha estado mientras tanto entrenando a Sasuke Uchiha, antiguo compañero de Naruto, que abandonó voluntariamente la aldea para ganar fuerza gracias a este personaje, y así poder tomar venganza contra su hermano, Itachi Uchiha.

Yu Ayase, hijo de una legendaria actriz ya fallecida, es tremendamente mediocre. Cuando recibe una invitación para mudarse a casa de una amiga de su madre, Yu se sorprende al descubrir que vivirá con tres hermanas superdotadas que son tan hermosas como inteligentes... y que gobiernan su nuevo instituto como las Tres Emperadoras. ¿Conseguirá Yu derretir los fríos corazones de las hermanas y cumplir el último deseo de su madre, que forme una familia feliz?

Un yakuza llamado Kyoji Narita se acerca a la presidenta del coro, Satomi Oka. El grupo yakuza de Kyoji celebra su habitual concurso de karaoke, y quien gane el título de peor cantante tendrá que hacerse un tatuaje. Como le han pedido que sea el profesor de canto de Kyoji, Satomi no tiene más remedio que participar en los ensayos. Unidos por el karaoke, ¿dónde acabarán Satomi y Kyoji?